Det är förmodligen sällan aktuellt med byggande i vatten som direkt påverkar djupa korallbiotoper, med undantag av offshoreverksamhet samt utläggning av kablar och pipelines. Kablar grävs ofta ner i havsbottnen för att undvika trålskador och korrosion. Det finns inte någon dokumentation om att kablar lagts ut genom kallvattenskorallrev. Allvarliga skador kan uppstå genom att sedimentpartiklar som resuspenderas vid nedgrävningen kan kväva närliggande rev. Därmed är det väsentligt att bedöma indirekt påverkan av förhöjda partikelhalter i vattnet pga. resuspension och strömtransport av partikulärt material till dessa känsliga biotoper.
Vid kabelläggning och utläggning av pipelines använder sig fartygen vanligen av flera tunga ankare som flyttas framåt efterhand som kabeln eller pipelinen läggs ut eller repareras. Dessa ankare kan skada närliggande kallvattenskorallrev.
I samband med muddring är det viktigt att se till att tippning av muddermassor inte görs på ett sådant sätt att massorna kan påverka djupa korallbiotoper. Detta kan ske antingen direkt genom övertäckning, eller indirekt genom resuspension av sedimentpartiklar och transport av dessa med bottenströmmar till korallbiotoper. Muddring och muddertippning kan också orsaka ändrade strömförhållanden som negativt kan påverka kallvattensrev.
