Vissa biotoper (eller habitat) utpekas specifikt i olika natur- och miljövårdssammanhang (internationella konventioner och direktiv, nationella regleringar mm, regionala och kommunala planer) . Detta innebär ofta en form av erkännande av biotopens stora betydelse, men kan också ge vägledning om hur biotopen identifieras, vilka hot som finns, hur biotopen bör skötas mm. Här nämner vi några sådana fall.
Grunda sedimentområden innehåller betydande biologiska och ekonomiska värden. När dessa värden ska tas i anspråk av olika intressenter uppstår konflikter eftersom olika typer av mänskliga aktiviteter påverkar miljön och möjligheten till alternativt nyttjande. Dessa konflikter har lett till att grunda miljöer ofta måste skyddas juridiskt. Exempelvis finns strandskyddet för att trygga förutsättningarna för allmänhetens friluftsliv och för att bevara goda livsvillkor på land och i vatten för djur och växter.
Natura 2000
(EU:s nätverk av skyddad natur)
Fem olika typer av grunda habitat ingår i EU:s Natura 2000 nätverk. Dessa är:
1110 Sublittorala sandbankar
1130 Estuarier
1140 Ler-och sandbottnar som blottas vid lågvatten
1150 Kustnära laguner
1160 Stora grunda vikar och sund
