Vissa biotoper (eller habitat) utpekas specifikt i olika natur- och miljövårdssammanhang (internationella konventioner och direktiv, nationella regleringar mm, regionala och kommunala planer). Detta innebär ofta en form av erkännande av biotopens stora betydelse, men kan också ge vägledning om hur biotopen identifieras, vilka hot som finns, hur biotopen bör skötas mm. Här nämner vi några sådana fall.
Natura 2000
(EU:s nätverk av skyddad natur)
Musselbottnar kan förekomma inom följande Natura 2000-habitat:
- 1110 Sublittorala sandbankar
- 1130 Estuarier
- 1150 Laguner
- 1160 Stora grunda vikar och sund
