Biotopen grunda mjukbottnar definieras främst med hjälp av områdets abiotiska egenskaper (lerigt – sandigt
sediment inom djupintervallet 0 – 10 m) och frånvaron av biotopbildande vegetation (t.ex. ålgräs eller nating). En exakt analys av sedimentets
storlekssammansättning kräver en komplicerad sållning, men man kan ofta visuellt avgöra om ett ytligt sediment domineras av silt, sand, grus
eller grövre sedimentkorn (se
tabell). Eftersom bestånd av sådan vegetation
kan variera i tiden, kan avgränsningen av biotopen
ibland vara svår och i viss mån artificiell. Ålgräsets utbredning inventeras bäst under sensommaren, då den är som störst
(se avsnittet om ålgräs). Därmed inventeras även förekomst av grunda sedimentbottnar lämpligen under denna period.